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sra数据库

发布时间: 2021-03-27 05:07:29

❶ 可不可以帮我从ncbi里面下一个SRA数据库,转到网盘发给我呀。谢谢了

抱歉毕业后转行多年,这种专业性题目帮不上忙了。

❷ 转录组测序所得的数据,怎样传到NCBI的SRA数据库

xshell连接NCBI服务器 输入命令 ftp

连接成功后输入账号 密码
mkdir命令创建一个文件夹,以版你的BioProject accession命名

FTP 连接权成功后连接成功后
进入刚才建立的BioProject文件夹
把原始数据拖进去即可

传输过程中,如果一定时间(五分钟?)没有激活传输界面,可能会导致连接断开
进度可能会一直停在99%,重新连接成功后,也一直卡在99%,不过似乎数据还是上传成功了的
传输成功的会显示linked,同时FTP里对应的文件会消失 传输成功的会显示linked,同时FTP里对应的文件会消失
全部文件夹都传输成功了会变成queued
然后就等NCBI处理了

❸ 如何将测序数据上传到NCBI的SRA数据库

随着高通量测序的发展,海量的数据源源不断的产生,以至于美国国家生物技术信息中心(NCBI)都受不了了,由于经费不足,于2011年2月关闭了Sequence Read Archive(SRA)数据库,停止接受用户提交的下一代测序数据。
近日,Google和TPG Biotech联合投资1500万美元致力于打造DNA云数据库,Google将和DNAnexus一起接管NCBI的海量数据库,继续为科研人员提供免费的DNA数据信息。

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