代谢组学数据库

① 1.求推荐一家靠谱的尿液代谢组学和血清代谢组学服务公司

(1) 尿液样品采集需要马上进行萃灭：快速使组织或细胞内的酶失活，防止代谢物的变化。液氮速冻是常用的萃灭方式。尿液采集后需立即放入-80℃或液氮保存。在NMR分析中，建议用0.2um滤膜过滤除菌。GC-MS分析中，由于尿素高温分解产生的氨气可能对检测其他物质造成干扰，因此分析前应加入尿素酶除去尿素。样本量要求200µL/例。LC-MS分析对样品则要求较少，仅需要弃去沉淀冻存即可。
（2）血液样品：包括血浆和血清，血清中代谢物的含量略高于血浆，血清和血浆均可用于代谢组学研究，但是取样尽量一致，要么都用血清，要么都用血浆。
血浆样品：应使用肝素钠抗凝管（EDTA等其余抗凝剂会对质谱信号有影响）采集全血，并尽快进行血浆分离：3000 rpm室温离心10 min，待血细胞完全沉降到管底后，取上层，0.2 mL/管分装至1.5 mL离心管中。-80°C冻存，干冰寄送。样本量要求100-200µL/例。
血清样品：血液收集在离心管中37°C(或室温)静置30 min或1 h进行凝固分层；3000 rpm室温离心10 min，待血细胞完全沉降到管底后，取上清转至干净的离心管中； 再12000 rpm 4°C离心10 min，取上清分装到1.5 mL离心管中，每管0.2 mL，-80 °C冻存，干冰寄送。样本量要求100-200µL/例。
现在市面上提供代谢组学的公司基本上都是基于LC-MS, GC-MS, NMR这三种技术展开。NMR技术的优点是样品可回收利用，但对复杂样品：例如血液样品的代谢组学分析，稍显力不从心，基于NMR的代谢组学数据库还没有大型的可参考标准物质谱图，这就使得解析谱图异常困难，遇到多物质的谱图重叠等问题很难解决。GC-MS由于需要样品衍生化，会有一部分物质丢失，并且由于精密度等原因，所测得的物质较少，并不能完整的反应该时刻的代谢轮廓特征。由于高分辨质谱的发展，配备有高分辨检测器的LC-MS例如LC-TOF-MS越来越成为了代谢组学样品分析的有利武器。并且随着MASSBANK, METLIN，HMDB等数据库的完善，使得LC-MS的数据的物质鉴定效率大大提升。不光如此，在样品的前处理中，使用LC-MS技术所需的处理步骤最为简单，可以很大程度上减少代谢物的流失。因此高分辨LC-MS技术已成为代谢组学中的主流手段被广泛使用。
目前国内做代谢组学的单位有很多，价格不一。如果是华北地区，可以考虑百泰派克，这家公司的价格很合理技术也挺好。
注意事项：建议尽量多的收集样本并分装冻存，100-200µL/管较为合适，且避免反复冻融。

② 与转录组学和蛋白组学比较，代谢组学有何优点

那年夏天Forever与转录组学和蛋白组学比较,代谢组学有以下优点：①代谢组学放大了基因和蛋白表达的微小变化,从而使检测更容易；②代谢组学的研究不需建立全基因组测序及大量表达序列 标签(EST)的数据库,且代谢产物的种类要远小于基因和蛋白的数目.③ 由于给定的代谢产物在每个组织中都是一样的,所以研究中采用的技术更为通用也更易被人们所接受.④ 生物体液的代谢产物分析可反映机体系统的生理和病理状态.通过代谢组学研究既可以发现生物体在受到各种内外环境扰动后的应答不同,也可以区分同种不同个体之间的表型差异,因此在国际医药、动植物、微生物等研究领域内得到了广泛应用.

③ 转录测序中的nr，nt，swissprot，cog，kegg，go分别是什么意思

NR库属于非冗余蛋白序列数据库，是官方的蛋白序列数据库，数据来源于GenPept、SwissProt、PIR、PDF、PDB以及NCBI RefSeq，是默认的蛋白比对数据库。
NT数据库是美国国家生物技术信息中心NCBI官方的核酸序列数据库，NT库属于非冗余核酸序列数据库,数据来源于GenBank、EMBL 以及 DDBJ，是NCBI默认的核酸blast比对数据库。
SwissProt数据库是检查过的、手工注释的蛋白数据库，我们将Unigene注释到SwissProt数据库，以得到更加高质量的注释结果。
COG (clusters of orthologous groups)主要是原核生物和单细胞真核生物的直系同源物，KOG(clusters of euKaryotic Orthologous Groups)数据库包含了7个完整基因组的真核生物的直系同源家族蛋白, 构成每个 KOG 的蛋白集是被假定为来自于一个祖先蛋白，根据系统发生进行分类，一般COG指原核生物，KOG指真核生物，KOG与COG提供了相似的基因同源物的分类信息。
KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) 是处理基因组、生物通路、疾病、药物和化学物质之间联系的集成数据库。 KEGG用于生物信息研究等，包括基因组，代谢组学等其他组学的数据分析，涵盖了Drug Development(药物开发)、 Cellular Processes(细胞过程)、 Environmental Information Processing(环境信息处理)、Genetic Information Processing(遗传信息处理)、 Human Diseases(人类疾病), Metabolism(代谢)、 Organismal Systems(有机系统)等方面。
GO( Gene Ontology ): 基因本体。生物技术的发展迅速，数据越来越多，不同数据库命名标准不统一，为了解决不同的生物学数据库可能会使用不同的术语的问题，从而基因本体联合会(Gene Onotology Consortium)开发GO来描述基因在分子、细胞和组织水平的功能体现。GO的基本描述单元是GO terms。GO主要包括三个分支: 生物过程(biological processes)、分子功能(molecular function)和细胞组成(cellular components)，用于描述基因产物的功能。GO中使用了is_a、part_of和regulates三种互作关系。

④ 出国留学几门课程描述（生物类的），中文就可以，最好是中英文对照的。懂得进~！！谢谢

生命伦理学，主要是介绍试验用动物处理啥的，挺无聊一门课。
生命安全，貌似生物类的应该是实验室安全课，这门很重要，因为以后可能十几二十年甚至一辈子都是在实验室里过的，认真学学没错的，上次我们院一个抽血技师血打翻了居然直接拿拖把拖掉，结果第二天就被开除了。
人类遗传学Human Genetics, 生物医学的基础课，很多临床课程都会用到里面的知识。
不良习惯与疾病，公卫的基础课，生物医学的选修课，感觉没啥用，而且上课就是打酱油。
工业微生物，主要是乳制品生产啥的，还有发酵啊什么的，不做Instry所以不是很了解，个人感觉应该蛮有意思的。
分子病毒学，病毒学高级课程，一般只有病毒学，微生物学，毒理学之类的PhD才学。
代谢组学，生化研究生水平课程，主要是酶啊，蛋白氨基酸啥的。
食用菌生物学，微生物学，植物学，食品科学的课程，不了解，大概就是说蘑菇的吧。
数据库管理系统，database貌似理工科都要学，此外还有VBVC编程，属于基础课。
微生物遗传学，主要就是微生物的遗传内容，因为微生物构造比较简单，而且原核生物，以及病毒都和真核生物不一样，挺好玩的，而且以后实验里经常用细菌来扩增想要的核酸序列哦，好好学。
生物技术制药，理解成制药就可以了。
基因工程，基因学一部分，没啥好说。
我估计楼主应该是学微生物的。