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sra資料庫

發布時間: 2021-03-27 05:07:29

❶ 可不可以幫我從ncbi裡面下一個SRA資料庫,轉到網盤發給我呀。謝謝了

抱歉畢業後轉行多年,這種專業性題目幫不上忙了。

❷ 轉錄組測序所得的數據,怎樣傳到NCBI的SRA資料庫

xshell連接NCBI伺服器 輸入命令 ftp

連接成功後輸入賬號 密碼
mkdir命令創建一個文件夾,以版你的BioProject accession命名

FTP 連接權成功後連接成功後
進入剛才建立的BioProject文件夾
把原始數據拖進去即可

傳輸過程中,如果一定時間(五分鍾?)沒有激活傳輸界面,可能會導致連接斷開
進度可能會一直停在99%,重新連接成功後,也一直卡在99%,不過似乎數據還是上傳成功了的
傳輸成功的會顯示linked,同時FTP里對應的文件會消失 傳輸成功的會顯示linked,同時FTP里對應的文件會消失
全部文件夾都傳輸成功了會變成queued
然後就等NCBI處理了

❸ 如何將測序數據上傳到NCBI的SRA資料庫

隨著高通量測序的發展,海量的數據源源不斷的產生,以至於美國國家生物技術信息中心(NCBI)都受不了了,由於經費不足,於2011年2月關閉了Sequence Read Archive(SRA)資料庫,停止接受用戶提交的下一代測序數據。
近日,Google和TPG Biotech聯合投資1500萬美元致力於打造DNA雲資料庫,Google將和DNAnexus一起接管NCBI的海量資料庫,繼續為科研人員提供免費的DNA數據信息。

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