代謝組學資料庫

① 1.求推薦一家靠譜的尿液代謝組學和血清代謝組學服務公司

(1) 尿液樣品採集需要馬上進行萃滅：快速使組織或細胞內的酶失活，防止代謝物的變化。液氮速凍是常用的萃滅方式。尿液採集後需立即放入-80℃或液氮保存。在NMR分析中，建議用0.2um濾膜過濾除菌。GC-MS分析中，由於尿素高溫分解產生的氨氣可能對檢測其他物質造成干擾，因此分析前應加入尿素酶除去尿素。樣本量要求200µL/例。LC-MS分析對樣品則要求較少，僅需要棄去沉澱凍存即可。
（2）血液樣品：包括血漿和血清，血清中代謝物的含量略高於血漿，血清和血漿均可用於代謝組學研究，但是取樣盡量一致，要麼都用血清，要麼都用血漿。
血漿樣品：應使用肝素鈉抗凝管（EDTA等其餘抗凝劑會對質譜信號有影響）採集全血，並盡快進行血漿分離：3000 rpm室溫離心10 min，待血細胞完全沉降到管底後，取上層，0.2 mL/管分裝至1.5 mL離心管中。-80°C凍存，乾冰寄送。樣本量要求100-200µL/例。
血清樣品：血液收集在離心管中37°C(或室溫)靜置30 min或1 h進行凝固分層；3000 rpm室溫離心10 min，待血細胞完全沉降到管底後，取上清轉至干凈的離心管中； 再12000 rpm 4°C離心10 min，取上清分裝到1.5 mL離心管中，每管0.2 mL，-80 °C凍存，乾冰寄送。樣本量要求100-200µL/例。
現在市面上提供代謝組學的公司基本上都是基於LC-MS, GC-MS, NMR這三種技術展開。NMR技術的優點是樣品可回收利用，但對復雜樣品：例如血液樣品的代謝組學分析，稍顯力不從心，基於NMR的代謝組學資料庫還沒有大型的可參考標准物質譜圖，這就使得解析譜圖異常困難，遇到多物質的譜圖重疊等問題很難解決。GC-MS由於需要樣品衍生化，會有一部分物質丟失，並且由於精密度等原因，所測得的物質較少，並不能完整的反應該時刻的代謝輪廓特徵。由於高分辨質譜的發展，配備有高分辨檢測器的LC-MS例如LC-TOF-MS越來越成為了代謝組學樣品分析的有利武器。並且隨著MASSBANK, METLIN，HMDB等資料庫的完善，使得LC-MS的數據的物質鑒定效率大大提升。不光如此，在樣品的前處理中，使用LC-MS技術所需的處理步驟最為簡單，可以很大程度上減少代謝物的流失。因此高分辨LC-MS技術已成為代謝組學中的主流手段被廣泛使用。
目前國內做代謝組學的單位有很多，價格不一。如果是華北地區，可以考慮百泰派克，這家公司的價格很合理技術也挺好。
注意事項：建議盡量多的收集樣本並分裝凍存，100-200µL/管較為合適，且避免反復凍融。

② 與轉錄組學和蛋白組學比較，代謝組學有何優點

那年夏天Forever與轉錄組學和蛋白組學比較,代謝組學有以下優點：①代謝組學放大了基因和蛋白表達的微小變化,從而使檢測更容易；②代謝組學的研究不需建立全基因組測序及大量表達序列 標簽(EST)的資料庫,且代謝產物的種類要遠小於基因和蛋白的數目.③ 由於給定的代謝產物在每個組織中都是一樣的,所以研究中採用的技術更為通用也更易被人們所接受.④ 生物體液的代謝產物分析可反映機體系統的生理和病理狀態.通過代謝組學研究既可以發現生物體在受到各種內外環境擾動後的應答不同,也可以區分同種不同個體之間的表型差異,因此在國際醫葯、動植物、微生物等研究領域內得到了廣泛應用.

③ 轉錄測序中的nr，nt，swissprot，cog，kegg，go分別是什麼意思

NR庫屬於非冗餘蛋白序列資料庫，是官方的蛋白序列資料庫，數據來源於GenPept、SwissProt、PIR、PDF、PDB以及NCBI RefSeq，是默認的蛋白比對資料庫。
NT資料庫是美國國家生物技術信息中心NCBI官方的核酸序列資料庫，NT庫屬於非冗餘核酸序列資料庫,數據來源於GenBank、EMBL 以及 DDBJ，是NCBI默認的核酸blast比對資料庫。
SwissProt資料庫是檢查過的、手工注釋的蛋白資料庫，我們將Unigene注釋到SwissProt資料庫，以得到更加高質量的注釋結果。
COG (clusters of orthologous groups)主要是原核生物和單細胞真核生物的直系同源物，KOG(clusters of euKaryotic Orthologous Groups)資料庫包含了7個完整基因組的真核生物的直系同源家族蛋白, 構成每個 KOG 的蛋白集是被假定為來自於一個祖先蛋白，根據系統發生進行分類，一般COG指原核生物，KOG指真核生物，KOG與COG提供了相似的基因同源物的分類信息。
KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) 是處理基因組、生物通路、疾病、葯物和化學物質之間聯系的集成資料庫。 KEGG用於生物信息研究等，包括基因組，代謝組學等其他組學的數據分析，涵蓋了Drug Development(葯物開發)、 Cellular Processes(細胞過程)、 Environmental Information Processing(環境信息處理)、Genetic Information Processing(遺傳信息處理)、 Human Diseases(人類疾病), Metabolism(代謝)、 Organismal Systems(有機系統)等方面。
GO( Gene Ontology ): 基因本體。生物技術的發展迅速，數據越來越多，不同資料庫命名標准不統一，為了解決不同的生物學資料庫可能會使用不同的術語的問題，從而基因本體聯合會(Gene Onotology Consortium)開發GO來描述基因在分子、細胞和組織水平的功能體現。GO的基本描述單元是GO terms。GO主要包括三個分支: 生物過程(biological processes)、分子功能(molecular function)和細胞組成(cellular components)，用於描述基因產物的功能。GO中使用了is_a、part_of和regulates三種互作關系。

④ 出國留學幾門課程描述（生物類的），中文就可以，最好是中英文對照的。懂得進~！！謝謝

生命倫理學，主要是介紹試驗用動物處理啥的，挺無聊一門課。
生命安全，貌似生物類的應該是實驗室安全課，這門很重要，因為以後可能十幾二十年甚至一輩子都是在實驗室里過的，認真學學沒錯的，上次我們院一個抽血技師血打翻了居然直接拿拖把拖掉，結果第二天就被開除了。
人類遺傳學Human Genetics, 生物醫學的基礎課，很多臨床課程都會用到裡面的知識。
不良習慣與疾病，公衛的基礎課，生物醫學的選修課，感覺沒啥用，而且上課就是打醬油。
工業微生物，主要是乳製品生產啥的，還有發酵啊什麼的，不做Instry所以不是很了解，個人感覺應該蠻有意思的。
分子病毒學，病毒學高級課程，一般只有病毒學，微生物學，毒理學之類的PhD才學。
代謝組學，生化研究生水平課程，主要是酶啊，蛋白氨基酸啥的。
食用菌生物學，微生物學，植物學，食品科學的課程，不了解，大概就是說蘑菇的吧。
資料庫管理系統，database貌似理工科都要學，此外還有VBVC編程，屬於基礎課。
微生物遺傳學，主要就是微生物的遺傳內容，因為微生物構造比較簡單，而且原核生物，以及病毒都和真核生物不一樣，挺好玩的，而且以後實驗里經常用細菌來擴增想要的核酸序列哦，好好學。
生物技術制葯，理解成制葯就可以了。
基因工程，基因學一部分，沒啥好說。
我估計樓主應該是學微生物的。